Mulliken için editoryal çalışma ve bilgilerin müdürü
İkinci Dünya Savaşı (1939-1945) sırasında oldu Chicago'nun Plütonyum Projesi ABD hükümetinin Manhattan Projesi, bir atom bombası üretmek için gizli araştırma programının bir bölümü Üniversitesi. Savaştan sonra, moleküler yapı ve spektrumları onun deneysel ve kuramsal analizler devam etti. O, verici-alıcı molekül kompleksleri, hesaplanan spektral yoğunlukların spektrumları şarj transfer yorumunu geliştirilen moleküler spektrumları geçişler karakterize seçim kurallarını açıkladı ve organik moleküllerin Hiperkonjugasyon teorisi yanı sıra nüfus analizi kavramını çalıştı. 1952 yılında Lewis asit ve baz molekülleri arasındaki etkileşimi analiz etmek için kuantum mekaniksel teorisini kullanılır. 1960 yılında yapı ve spektrumları okumamış sadece moleküler hidrojen, helyum, azot ve diğer küçük moleküller, aynı zamanda karmaşık moleküler agrega arasında.
Mulliken Ulusal Bilimler Akademisi üyeliğine seçildi 1936 ve ayrıca Sanat ve Bilim, American Chemical Society Amerikan Akademisi ve Amerikan Felsefe Derneği üyesiydi; Büyük Britanya Royal Society of yabancı üyesi; Société de Chimie Fizik fahri üyesi; ve Liege Bilim Royal Society karşılık gelen bir üyesi. O da American Physical Society ve Advancement of Science için Amerikan Derneği ve İngiltere Chemical Society ve Hint Bilim National Academy fahri arkadaşı bir adam oldu.
1965 yılında, Mulliken başladı Tallahassee Florida State Üniversitesi Moleküler Biyofizik Enstitüsü Kimya Fizik Değerli Araştırma Profesörü olarak her yıl bir kısmını harcama. Onun için 1966 yılında verilen Nobel Ödülü, ek olarak "kimyasal bağlar ve moleküler orbital yöntemi ile moleküllerin elektronik yapıları konusunda temel çalışmaları," Mulliken 1960'lı yıllarda Amerikan Kimya Derneği tarafından beş ödül aldı: GN Lewis Madalyası, Theodore William Richards Madalyası, Peter Debye Ödülü, John Gamble Kirkwood Ödülü ve J. Willard Gibbs Madalyası.
