10 yıldır, 1857 den, Pasteur Ecole Normale de bilimsel çalışmaların yönetmen olarak çalıştı. O yaptığı araştırma odaklanmak için 1867 yılında bu görevinden ayrıldı. Erken 1860 yılında şarap çünkü yapılan edilirken şarap girin mikroplar (mikroplar) acı döner fark etti. O ısı kontrollü bir miktarda tatbik şarap lezzet değiştirmeden mikropları öldürebilir gösterdi. Mikropları öldürmek için bir araç olarak ısı Bu kullanım Pasteur sonra, pastörizasyon olarak tanındı. Pasteur ayrıca süt, bira ve gıda korumak için bu yöntemi kullandı.
1865 yılında, Pasteur ipek endüstrisine yardım için yola çıktı. Pebrine denen bir hastalık böceklerinin büyük sayıda öldürüyordu. O ipekböceği yumurta saldıran bir mikrop hastalığa neden olduğunu kanıtlamak için birkaç yıl çalıştı. O İpekböceği fidanlıklarda bu mikrobu ortadan hastalığı silip olacağını gösterdi. İpekböceği hastalık haline yaptığı araştırma, güney Fransa'da ipek endüstrisini kurtardı.
Pasteur birçok hastalığın vücutta çoğalır mikropların neden olduğu kanıtlanmıştır. O da mikropların bir laboratuvarda zayıflamış ve daha sonra bir hayvanın vücudunda yerleştirilir eğer, hayvan mikrobu bir bağışıklık (direnç) geliştirir olduğunu kanıtladı. O mikropların aşı kapalı mücadele bu yöntemi denir. Pasteur şarbon denilen ciddi bir enfeksiyon hastalığına karşı koyun aşılayarak aşılama değerini kanıtladı. Edward Jenner, 1790 yılında en çiçek bağışıklık insanları yapma güvenli bir yöntem bulduklarını bir İngiliz hekim başarıdan Pasteur ödünç fikirler. Jenner, bir sığır çiçeği boğaz madde ile genç bir çocuk aşılanmış. Çocuk, çiçek ile ilgili nispeten zararsız bir hastalık sığır çiçeği geliştirdi. Jenner sonra çiçek boğaz madde ile çocuk enjekte edildiğinde Ama, çocuk o hastalığı ile aşağı gelmedi. Cowpox ile yaptığı maçın bedeni çiçek karşı bağışıklık oluşturmak yardımcı olmuştu. Jenner klasik deney ilk resmi kayıtlı aşı oldu.
Pasteur kuduz, kuduz ile enfekte hayvanların ısırması ile yayılan bir enfeksiyon hastalığı incelemek için 1881 yılında başladı. Kuduz beynin bir kısmının sinir hücreleri yok eder ve hemen hemen her zaman ölüme neden olur. İnsan ve diğer birçok memeli hastalığa yakalayabilirsiniz. Tükürük bezlerinde yapılır bir
