1971 olarak, Boyer ATP sentezini anlamada önemli ilerlemeler yapmıştı. Aşağıdaki on yılında ATP sentezi bağlama mekanizması için üç önermeleri ile ilgili ek keşifler yaptı. Boyer ve onun araştırma ekibi tarafından ayrıntılı test sonuçlarını doğruladı. Boyer enzim ATP sentaz ATP üretimini yardımcı olduğunu gösterdi ve Birleşik Krallık John Ernest Walker ATP sentaz yapısını keşfetti. Çalışmaları için, iki bilim adamı kimya yarısı 1997 Nobel Ödülü'nü paylaştı. Ödülün diğer yarısı Danimarka Jens Skou verildi.
1955 yılında, Boyer American Chemical Society enzim kimyada ödülünü aldı. O da ona bir dini alıp Stockholm Üniversitesi Wenner-Gren Enstitüsü ve Nobel Tıp Enstitüsü İsveç'te araştırma yapmak için izin Guggenheim Fellowship aldı. 1970 1969 itibaren 1960 için 1959 Amerikan Kimya Derneği biyokimya bölümünün başkanı olarak görev yaptı o Biyolojik Kimyagerler Amerikan Derneği başkanı oldu. 1970 yılında UCLA Kimya ve Biyokimya Bölümü emekli profesör seçildi. 1989 yılında Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Amerikan Derneği'nin Gül Ödülü'nü aldı.