Harvard'da Whipple ilk işi gökyüzünün fotoğraf plakaları doğruluğunu kontrol ediyordum. Görev daha ilginç hale getirmek için o kuyruklu için fotoğraf negatifleri inceledi. Bu çalışmalar esnasında, o şimdi onun adını taşıyan tüm bunların altı kuyruklu yıldızlar, keşfetti.
Kariyerinin başlarında, Whipple göktaşları hakkında daha fazla bilgi için yola çıktı. Bunu gerçekleştirmek için, o göktaşları yörüngesini ölçmek için iki istasyon fotoğrafik bir yöntem geliştirmiştir. Dönen kepenkleri ile kameralar kullanarak, Whipple farklı yerlerde göktaşları fotoğraflarını çekti. Daha sonra güneşin etrafında göktaşları 'atmosferik sürükle, hız ve yörünge belirlemek için fotoğraf klişeleri okudu. Dünya Savaşı (1939-1945) tarafından kesildi kadar Whipple bu araştırmayı sürdürdü. Yaptığı araştırma itibaren o kuyrukluyıldızların göktaşları ile ilgili ve benzer bir bileşime sahip olduğunu teorize. Sorunun bu şekilde onu kuyrukluyıldız çekirdekler kirli kartopu gibi olduğunu fikri formüle yardımcı oldu.
1932 yılında, Whipple altı yıl sonra eğitmenine ilerleyen, Harvard Üniversitesi astronomi öğretim atandı. Dünya Savaşı sırasında, 1945 yılında Savaşın sonunda 1948 yılında Merit Başkanlık Sertifikası kazanç, Harvard Radio Araştırma Laboratuvarlarında savaşla ilgili araştırma üzerinde çalıştı, Whipple o doçent seçildi Harvard döndü. Beş yıl sonra profesör, o Astronomi emekli Phillips Profesörü olarak emekli zaman o 1977 yılına kadar düzenlenen bir pozisyona terfi ettirildi. Harvard süresi boyunca, o da astronomi bölüm başkanı olarak görev yaptı.
onun meteor araştırmadan sonra, Whipple bilim adamları şaşkın bir sorunu çözmek için 40 kuyruklu yıldızların yörüngesini okudu. Bazı kuyruklu yıldızlar, diğerleri enerji kaybeder iken kendi yörüngeleri artırmak ve onların yörüngelerini azaltmak neden Astronomlar belirsiz idi. Whipple çekirdeğinin bileşimi bir aç
