1987 yılında beş Orta Amerika ilçeleri tarafından imzalanmış bir barış planı ile uyum savaşta muhalif gruplar tarafından bir anlaşma olmasına rağmen, iç savaş devam etti. Alfredo Cristiani, Arena partisinin, bir ateşkes imzalandı 1991 yılında 1989 yılında başkan seçildi. Iç savaş resmen gerilla güçleri hükümet tarafından siyasi ve ekonomik reformların bir program karşılığında dağıtma kabul ettiği bir plan çerçevesinde 1992 yılında sona erdi. 1994 yılında ilk savaş sonrası seçimde, Armando Calderon Sol, Arena partisinin cumhurbaşkanı seçildi. 1998 yılında Hurricane Mitch ülkede yaygın hasara yol açtı.
2001 yılının başında, El Salvador depremler yaklaşık 1200 kişinin ölümüne ve 1 milyondan fazla insan evsiz kaldı. 2004 yılında, Elias Antonio (Tony) Saca başkanı seçildi. Ayrıca, 2004 yılında, El Salvador Dominik Cumhuriyeti-Orta Amerika-Amerika Birleşik Devletleri Serbest Ticaret Anlaşması (CAFTA-DR) onayladı. Anlaşmanın bu niyeti katılımcı ülkeler arasında ticaret engellerini azaltmak oldu. Mart, 2009 yılında 2006
yürürlüğe girmiştir, Salvadorluların solcu Farabundo Marti Ulusal Kurtuluş Cephesi (FMLN) başkanı Mauricio Funes seçildi. Funes Haziran ayında göreve başladı. Muhafazakar Milliyetçi Cumhuriyetçi İttifak (ARENA) yaklaşık 20 yıldır iktidarda olmuştu. 
[1] [2]