2000 yılı sonu itibariyle, Taliban ülkenin yüzde 90'ından fazlasını kontrol ama gruplar, Kuzey gibi Taliban karşıtı İttifak, kuzeyde kalelerini vardı. Devam mücadele şiddetli bir kuraklık ve kıtlık etkilerini daha da kötüleşti.
Eylül 2001 yılında Amerika Birleşik Devletleri hükümeti talep
Taliban karşısında, 11 Eylül 2001 terörist saldırıları organize şüphelenilen Usame bin Ladin, feragat Amerika Birleşik Devletleri. Bu saldırılar onların çöküş neden New York'ta Dünya Ticaret Merkezi'nin ikiz kulelerine uçakla edildi ikisi dört uçak, bir kaçırma dahil. Taliban, Amerika Birleşik Devletleri taleplerini reddetti. Ekim ayında, Amerika Birleşik Devletleri ve Kuzey İttifakı'nın da dahil olmak üzere müttefikleri, Taliban'a karşı ve Afganistan'daki El Kaide güçlerine karşı sürekli bir askeri kampanya başlattı.
Kasım 2001 sonu itibariyle, Taliban kaldırılmış Güç ve Hamid Karzai liderliğindeki geçici hükümet, ile değiştirilir. Hükümet Afganistan'da barış ve güvenliğin korunması, ulusal konsey seçilmiş olabilir ve demokratik seçimler yapılacak verebilecek kadar, diğer şeylerin yanı sıra, suçlandı. Ülke için yeni bir anayasanın kabulünden sonra 2004 yılında düzenlenen ulusal seçimlerde Karzai cumhurbaşkanı seçildi. Yeni hükümeti kurmakla gelişmelere rağmen, bölgesel ve etnik çatışmalar rakipler arasındaki onun istikrarsızlığa katkıda ülke çapında devam etti. Yeni hükümet için hayati destek, Birleşmiş Milletler tarafından sağlanan ediliyordu.
2009 yılı Ağustos ayında, Afganistan başkanlık seçimlerini düzenledi ve Karzai en çok oyu aldı. Ancak, birçok oylama usulsüzlük, bir akış seçim zamanlanmış yol bulundu. Seçimden önce, Karzai'nin rakibi çekildi. Seçim yetkilileri, Karzai'nin başkanlığını kazandığını ilan etti.