bölgedeki Azeriler ve Ermeniler arasında etnik ve dini farklılıklar, iki grup arasında gerginliğe yol açtı. Gerginlikler 1980 sonlarında gül ve mücadele Dağlık Karabağ, Azerbaycan içinde ağırlıklı olarak Ermeni bölgede patlak verdi. 1990 yılında Sovyet birlikleri düzeni sağlamak için bölgeye sevk edildi.
1990-91 sırasında, sendika cumhuriyetleri boyunca milliyetçiliği yükselen kademeli Sovyet merkezi hükümetin otoritesini aşınmış. 1991 yılında Sovyetler Birliği çöktü ve Azerbaycan bağımsız oldu. Aynı yıl, Azerbaycan Bağımsız Devletler Topluluğu (BDT), eski Sovyet cumhuriyetlerinin gevşek bir konfederasyon katıldı. Azeriler ve Dağlık Karabağ Ermeniler yoğun arasında 1992 çatışma sırasında.
Haziran 1992 yılında Abulfez Elçibey Azerbaycan'ın ilk halk tarafından seçilen cumhurbaşkanı oldu. 1993 döneminde Azerbaycan güçleri Dağlık Karabağ ve çevresinde tüm parçaları ele isyancı Ermenilerin elinde, birkaç felaket yenilgiler. 1993 yazında, Elçibey silahlı kuvvetlerde bir hizip tarafından devrildi. Haydar Aliyev oyunculuk başkan atandı ve Ekim 1993 yılında, başkan seçildi. 1994 yılının baharında, bir ateşkes Azeriler ve isyancı Ermeniler arasında müzakere edilmiştir.
